Technicien-Technicienne en virologie et génomique cliniques - H/F

Description du poste

Versant

Fonction Publique de l'Etat

Catégorie

Catégorie B (profession intermédiaire)

Nature de l'emploi

Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels

Domaine / Métier

Chercheuse / Chercheur

Statut du poste

Vacant

Descriptif de l'employeur

L'Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) est un établissement public d'enseignement supérieur et de recherche sous tutelle du Ministère en charge de l'Agriculture (www.envt.fr).
L'Etablissement a pour mission première la formation des vétérinaires (180 diplômés par an) dans le cadre d'un référentiel de formation national qu'il se doit de respecter. L'Ecole est accréditée par l'Association Européenne des Etablissements Vétérinaires (AEEEV) et donc soumise au respect des normes de cette association. Les équipes d'enseignants sont regroupées au sein de trois départements :
- Elevage et produits/Santé publique vétérinaire,
- Sciences biologiques et fonctionnelles,
- Sciences cliniques des animaux de compagnie, de sport et de loisirs.
En matière de recherche, l'Etablissement accueille plusieurs équipes de scientifiques (la plupart sont des UMR avec une cotutelle INRAe, INSERM, UPS, …) en lien avec la santé animale, l'hygiène des aliments ou la génétique.

Descriptif du service

L'UMR ENVT-INRAE IHAP (Interactions Hôtes Agents Pathogènes) est un laboratoire pluridisciplinaire qui conduit des recherches sur les maladies infectieuses animales d'importance prioritaire pour la santé de l'animal et la santé publique, dans une approche « une seule santé ». Cette unité couvre différents types d'agents pathogènes (virus, bactéries, parasites), d'hôtes (ruminants, volailles, modèles rongeurs, faune sauvage, …) et d'échelles. Au plan de la formation à la recherche, IHAP est un acteur majeur de l'Ecole Universitaire de Recherche « maladies infectieuses émergentes » (UNITEID) nouvellement créée.
Le poste de technicien(ne) s'inscrit dans le contexte du développement très important des projets de recherche en virologie clinique depuis plus de 5 ans.

Description du poste

Au sens large, les objectifs du poste consistent à appuyer les projets de recherche en virologie (équipe VIRAL, UMR IHAP) : assurer un soutien technique, participer aux taches transversales dans l’unité et participer à l’encadrement et la formation des étudiants et stagiaires.

Mission 1 : virologie clinique

·         Réceptionner, reconditionner, enregistrer (barcoding) et stocker les échantillons selon un protocole de qualité défini, tenir un cahier d’expériences, rassembler et analyser les résultats, les mettre en forme et en rendre compte.

·         Réaliser, à partir de protocoles définis, des expériences de préparation et d’analyse utilisant un ensemble de techniques (culture virale sur cellules et in ovo, PCR conventionnelle, temps réel et digitale, électrophorèse sur gel d’agarose, autres techniques de biologie moléculaire…)

·         Actualiser le dossier de protocoles techniques.

·         Consulter et exploiter une documentation technique.

 

Mission 2 : génomique appliquée à la virologie clinique

·         Mettre en œuvre les méthodes spécifiques de préparation des acides nucléique en vue du séquençage NGS

·         Préparer des banques de séquençage NGS, lancement des essais (« runs ») de séquençage et gestion des consommables de séquençage.

·         Sauvegarde des données de séquençage NGS et premières analyses de contrôle qualité.

 

Mission 3: formation et encadrement des étudiants et stagiaires

·         Accompagnement de stagiaires et de thésards vétérinaires (thèse d’exercice vétérinaire), résidents des collèges de spécialistes vétérinaires,

·         Accompagnement d’étudiants en stage de master et doctorants en thèse de 3ème cycle), notamment dans le cadre de l’EUR UNITEID.

·         Participer à la formation technique des utilisateurs et des stagiaires (bonnes pratiques de laboratoire, règles d’hygiène et sécurité), en lien avec l’assistante de prévention Hygiène et sécurité de l’UMR IHAP et des assistants de prévention des tutelles ENVT et INRAE.

 

Mission 4 : appui logistique à l’activité du laboratoire de virologie clinique et de l’UMR IHAP

·         Assurer la surveillance des équipements scientifiques, la maintenance de premier niveau et l’entretien du laboratoire

·         Se former à la mise en œuvre des nouvelles techniques dans le service et initier/accompagner les utilisateurs.

·         Appliquer, en situation de travail, les bonnes pratiques de laboratoire, les règles d’hygiène et de sécurité et celles spécifiques à la manipulation de certains produits.

·         Participer à la gestion des stocks et des commandes

·         Participer activement à la mise à jour du processus qualité du laboratoire.

Descriptif du profil recherché

Savoirs

•       Connaitre les techniques de biologie moléculaire de base

•       Bonnes pratiques de laboratoire

•       Savoir appréhender les risques chimiques et biologiques liés aux produits, matériels et techniques utilisées.

•       Savoir utiliser les logiciels liés aux techniques expérimentales et à la présentation des résultats.

•       Comprendre une documentation en anglais

•       Bonnes capacités rédactionnelles

•       Des notions de NGS et métagénomiques seraient appréciées.

 

Savoir-faire

•       Organiser et conduire son activité avec rigueur, autonomie et fiabilité

•       Savoir manipuler dans des conditions stériles et travailler en milieu confiné

•       Savoir utiliser les équipements de base d’un laboratoire (thermocycleur, microscope, centrifugeuse, spectrophotomètre, balance, …)

•       Communiquer et collaborer avec les autres parties prenantes d’un projet.

•       Savoir rendre compte, travailler en équipe

Savoir transférer ses connaissances pour l’accompagnement à l’utilisation d’outils

Temps plein

Oui

Rémunération fonctionnaires

Selon grille indiciaire Technicien Formation Recherche (cat B)

Rémunération contractuels (en € brut/an)

26900€ à 35660€ selon expérience professionnelle

Carrière et rémunération fonctionnaires

Parcours professionnel

Sans objet

Corps / Groupe RIFSEEP

Groupe : G2.2
Référence : Note de service SG/SRH/SDCAR/ 2025-708 du 22/10/2025

Informations complémentaires

Informations complémentaires

Adresser votre dossier de candidature : une lettre de motivation et un CV personnalisé (vos fichiers seront nommés : NOMPrénom_CV, et NOMPrénom_LM)
A l'attention de la Direction des ressources humaines : recrutement@envt.fr

Fondement juridique du recrutement

articles L332-2 et L332-7 du Code général de la fonction publique

Télétravail possible

Non

Management

Non

Focus sur les activités

Le poste de technicien(ne) s'inscrit dans le contexte du développement très important des projets de recherche en virologie clinique depuis plus de 5 ans. Cette activité s'est traduite par les productions suivantes :
• Prise en charge de 786 dossiers cliniques en 2023 et 1218 en 2024 (soit environ 9000 échantillons biologiques primaires) : détection virale par PCR en temps réel, PCR multiplex ou PCR digitale ; séquençage Sanger ou de de nouvelle génération Oxford Nanopore ou illumina ; dosage immunologique par technique ELISA. Ces dossiers couvrent un large spectre de pathogènes et d'espèces cibles : aviaire, ruminants, faune sauvage, carnivores domestiques, lapins, poissons.
• Collaboration avec le CHU de Toulouse
• Plusieurs projets de recherche ont permis la constitution progressive, d'un plateau complet en génomique adapté au diagnostic microbiologique : robots d'extraction d'acides nucléiques, station d'analyse des acides nucléiques (« TapeStation »), thermocycleurs classiques, temps-réel, PCR digitale, RNA Scope, séquenceur Oxford nanopore, …
• Publication de 30 articles concernant les travaux de virologie clinique
• Encadrement de stagiaires et d'étudiants en thèse de Doctorat Vétérinaire : sur les 5 dernières années, 32 thèses ont bénéficié du support de l'équipe VIRAL.
• Encadrement de résidents de collèges européens pour leurs projets de recherche clinique

Environnement et qualité de vie au travail

Droit à Congé annuel : 50 jours
Restaurant administratif
Site de l'École vétérinaire arboré sur 54 hectares

Localisation du poste

Localisation du poste

Europe, France, Occitanie, Haute Garonne (31)

Géolocalisation du poste

23 chemin des Capelles 31300 TOULOUSE

Lieu d'affectation (sans géolocalisation)

23 chemin des Capelles 31300 TOULOUSE

Critères candidat

Niveau d'études / Diplôme

Niveau 5 Diplômes de niveau bac +2

Niveau d'expérience min. requis

Confirmé

Demandeur

Date de vacance de l'emploi

01/03/2026

Contact

Jean-Luc GUERIN - Directeur IHAP - jean-luc.guerin@envt.fr
Guillaume CROVILLE - Ingénieur de recherche - guillaume.croville@envt.fr